BioPortal to największe repozytorium ontologii tworzonych na potrzeby biomedycyny. Portal został stworzony przez The National Center for Biomedical Ontology w 2005 roku i na dzień dzisiejszy zawiera 419 ontologii opisujących 5,956,213 klas.

Dla każdej z umieszczonych na portalu ontologii wyliczane są metryki szczegółowo opisane tutaj. Wyliczone metryki są następnie przechowywane w metadanych ontologii.

Metryki podzielone są na dwie grupy:

1. Statistical metrics [Podstawowe metryki statystyczne]
   • Classes count
   • Properties count
   • Individuals count
   • Maximum depth
   • Average siblings count
   • Maximum siblings count
2. Quality-control/quality-assurance metrics [Metryki jakości]
   • Classes with only one subclass
   • Classes with more than 25 subclasses
   • Classes with no definition

Dostęp do metryk jak i ontologii możliwy jest poprzez portal jak i usługę REST (dokładniej opisany tutaj).

Przykładowo pod adresem http://data.bioontology.org/metrics znajduje się zestaw wszystkich metryk dla każdej z dostępnych ontologii. Załóżmy, że interesuje nas ontologia OBIWS (The Bioinformatics Web Services ontology). Jej metryki znajdują się pod adresem: http://data.bioontology.org/ontologies/OBIWS/submissions/2/metrics.

Tą samą ontologię wraz z metrykami znajdziemy na portalu pod adresem http://bioportal.bioontology.org/ontologies/OBIWS.